選擇最適合于某種用途的清潔劑種類，需考慮這樣三個(gè)因素：
    （1） 膜上沉積污垢的種類
    （2） 膜的種類
    （3） 應(yīng)用要求
    以下所列出的是一些最常用的清潔劑與清洗條件：
    A. 0.3 – 0.5M 氫氧化鈉（NaOH）（25 - 45℃）
    0.5M NaOH + 200 - 400ppm 次氯酸鈉（25 - 45℃），此為最佳清潔劑。
    這些清潔劑通常被應(yīng)用于生物制品的加工中，NaOH能有效地溶解并水解大多數(shù)的蛋白質(zhì)，脂類和多糖化合物，在NaOH溶液（pH 10-13）中加入一些含氯試劑能增強(qiáng)清洗能力，因?yàn)檫@些含水量氯試劑能氧化降解蛋白類的污垢和其它一些有機(jī)污垢而不影響不銹鋼表面，清洗過(guò)程大約需30-60分鐘。

    B. 0.1M – 0.5M硝酸、檸檬酸或磷酸溶液（25 - 35℃）
    酸性清洗劑對(duì)處理那些在低PH條件下溶解的污垢（這些污垢具有較高的等電點(diǎn)）非常有效，典型的污垢有DNA、多糖，細(xì)菌細(xì)胞和無(wú)機(jī)污垢，清洗過(guò)程一般為30 - 60分鐘。

    C. 100 - 400ppm過(guò)氧乙酸
    具有很強(qiáng)的滅菌功能，可作為含氯試劑的替代物，是極好的清潔衛(wèi)生試劑。

    D. 去垢劑或表面流行性劑
    Triton X –100(非離子表面活性劑)和十二烷基磺酸鈉（SDS）是非常有效的清潔劑，同時(shí)不會(huì)損傷膜，它們被應(yīng)用于清除以下污垢，蛋白類、脂肪、油和其它生物多聚物，清潔過(guò)程為30 – 90分鐘。

    E. 酶
    酶類清潔劑，如0.1% - 0.5% 的胰蛋白酶和P3 Ultrasil 56. 對(duì)清洗被細(xì)胞碎片嚴(yán)重污染的膜的有效的。由于酶反應(yīng)較慢，經(jīng)常不能反應(yīng)完全，同時(shí)酶本身也是蛋白質(zhì)，需用其它清洗劑來(lái)去除。因此在所有清洗劑中酶清洗劑最少被推薦使用。